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    %0 Book Section
    %A Giavitto, Jean-Louis
    %A Michel, Olivier
    %A Spicher, Antoine
    %T Interaction−Based Modeling of Morphogenesis in MGS
    %D 2013
    %E R. Doursat and H. Sayama
    %B Morphogenetic Engineering
    %I Springer
    %P 409-440
    %F Giavitto13c
    %X In this chapter, we advocate a domain specific language (DSL) approach to overcome the difficulties of modeling and simulating morphogenetic processes. A careful discussion of the design goals of a DSL leads to the development of an ex- perimental programming language called MGS. Its declarative approach is based on the notion of topological collection originating from algebraic topology. Topologi- cal collections arise naturally when modeling a "dynamical system with a dynamic structure", or (DS)2, as the state of the system. The evolution function of the system is specified by a transformation, which is a set of rewriting rules where each rule defines a local interaction. We illustrate these notions through different models of the same morphogenetic process: the growth of a T-shaped structure. The objective is to show how a variety of models can be consistently handled within the MGS framework. DOI: 10.1007/978-3-642-33902-8_16
    %1 4
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    © Ircam - Centre Pompidou 2005.